Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N2

Vmn1r188, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r188Q8K3N2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r188Q8K3N2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms