Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MyripQ8K3I4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MyripQ8K3I4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms