Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SrrdQ8K2M3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SrrdQ8K2M3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms