Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Mtmr3Q8K296 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Mtmr3Q8K296 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Mtmr3Q8K296 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Mtmr3Q8K296 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Mtmr3Q8K296 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Mtmr3Q8K296 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Mtmr3Q8K296 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Mtmr3Q8K296 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Mtmr3Q8K296 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtmr3Q8K296 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms