Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pacs1Q8K212 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs1Q8K212 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms