Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Lrit1Q8K099 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Lrit1Q8K099 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Lrit1Q8K099 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Lrit1Q8K099 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Lrit1Q8K099 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Lrit1Q8K099 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Lrit1Q8K099 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Lrit1Q8K099 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrit1Q8K099 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Lrit1Q8K099 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
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Lrit1Q8K099 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Lrit1Q8K099 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Lrit1Q8K099 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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