Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LgsnQ8CIX8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LgsnQ8CIX8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms