Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFW7

Cc2d2a, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cc2d2aQ8CFW7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cc2d2aQ8CFW7 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cc2d2aQ8CFW7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cc2d2aQ8CFW7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cc2d2aQ8CFW7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cc2d2aQ8CFW7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cc2d2aQ8CFW7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cc2d2aQ8CFW7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cc2d2aQ8CFW7 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cc2d2aQ8CFW7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cc2d2aQ8CFW7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cc2d2aQ8CFW7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cc2d2aQ8CFW7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cc2d2aQ8CFW7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cc2d2aQ8CFW7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cc2d2aQ8CFW7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cc2d2aQ8CFW7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cc2d2aQ8CFW7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cc2d2aQ8CFW7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cc2d2aQ8CFW7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cc2d2aQ8CFW7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cc2d2aQ8CFW7 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Cc2d2aQ8CFW7 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Cc2d2aQ8CFW7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Cc2d2aQ8CFW7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cc2d2aQ8CFW7 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cc2d2aQ8CFW7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cc2d2aQ8CFW7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cc2d2aQ8CFW7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms