Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Hpf1Q8CFE2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Hpf1Q8CFE2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Hpf1Q8CFE2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Hpf1Q8CFE2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Hpf1Q8CFE2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Hpf1Q8CFE2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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