Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Gm9955Q8CEJ8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms