Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Pramef8Q8CE24 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pramef8Q8CE24 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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