Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Nsun3Q8CCT7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Nsun3Q8CCT7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Nsun3Q8CCT7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Nsun3Q8CCT7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Nsun3Q8CCT7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Nsun3Q8CCT7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nsun3Q8CCT7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Nsun3Q8CCT7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nsun3Q8CCT7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nsun3Q8CCT7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Nsun3Q8CCT7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Nsun3Q8CCT7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsun3Q8CCT7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsun3Q8CCT7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsun3Q8CCT7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsun3Q8CCT7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Nsun3Q8CCT7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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Nsun3Q8CCT7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsun3Q8CCT7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsun3Q8CCT7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsun3Q8CCT7 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsun3Q8CCT7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsun3Q8CCT7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsun3Q8CCT7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsun3Q8CCT7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsun3Q8CCT7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsun3Q8CCT7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsun3Q8CCT7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsun3Q8CCT7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsun3Q8CCT7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsun3Q8CCT7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsun3Q8CCT7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsun3Q8CCT7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsun3Q8CCT7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nsun3Q8CCT7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms