Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg4aQ8C9S8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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Atg4aQ8C9S8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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Atg4aQ8C9S8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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Atg4aQ8C9S8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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Atg4aQ8C9S8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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Atg4aQ8C9S8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg4aQ8C9S8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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