Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp20Q8C6M1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms