Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms