Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4Y3

Nelfb, Negative elongation factor B, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfbQ8C4Y3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfbQ8C4Y3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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