Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0E3

Trim47, Tripartite motif-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim47Q8C0E3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Trim47Q8C0E3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Trim47Q8C0E3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim47Q8C0E3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim47Q8C0E3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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