Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdsp2Q8BX07 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms