Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Zfp398Q8BV16 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Zfp398Q8BV16 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Zfp398Q8BV16 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zfp398Q8BV16 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Zfp398Q8BV16 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Zfp398Q8BV16 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Zfp398Q8BV16 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Zfp398Q8BV16 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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