Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Pggt1bQ8BUY9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
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Pggt1bQ8BUY9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Pggt1bQ8BUY9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Pggt1bQ8BUY9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Pggt1bQ8BUY9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Pggt1bQ8BUY9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pggt1bQ8BUY9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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