Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP27

Sfr1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfr1Q8BP27 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sfr1Q8BP27 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms