Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpc2Q8BKV1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms