Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg4dQ8BGV9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms