Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atg4bQ8BGE6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg4bQ8BGE6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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