Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW4

Trim65, Tripartite motif-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim65Q8BFW4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim65Q8BFW4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim65Q8BFW4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms