Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd4Q8BFT6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Jmjd4Q8BFT6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Jmjd4Q8BFT6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd4Q8BFT6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd4Q8BFT6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd4Q8BFT6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd4Q8BFT6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd4Q8BFT6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd4Q8BFT6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd4Q8BFT6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd4Q8BFT6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd4Q8BFT6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd4Q8BFT6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd4Q8BFT6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd4Q8BFT6 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd4Q8BFT6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms