Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZQ7

BC048562, cDNA sequence BC048562, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048562Q80ZQ7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BC048562Q80ZQ7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms