Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc155Q80VJ8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc155Q80VJ8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc155Q80VJ8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc155Q80VJ8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc155Q80VJ8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc155Q80VJ8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc155Q80VJ8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc155Q80VJ8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc155Q80VJ8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc155Q80VJ8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc155Q80VJ8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc155Q80VJ8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc155Q80VJ8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc155Q80VJ8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms