Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pja2Q80U04 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pja2Q80U04 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pja2Q80U04 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pja2Q80U04 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms