Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnf1Q7TSH7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms