Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Dsg1bQ7TSF1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Dsg1bQ7TSF1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Dsg1bQ7TSF1 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Dsg1bQ7TSF1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Dsg1bQ7TSF1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Dsg1bQ7TSF1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Dsg1bQ7TSF1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Dsg1bQ7TSF1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Dsg1bQ7TSF1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Dsg1bQ7TSF1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Dsg1bQ7TSF1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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