Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Tnfsf18Q7TS55 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf18Q7TS55 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms