Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Sys1Q78S06 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Sys1Q78S06 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Sys1Q78S06 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sys1Q78S06 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Sys1Q78S06 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Sys1Q78S06 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Sys1Q78S06 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Sys1Q78S06 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Sys1Q78S06 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Sys1Q78S06 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sys1Q78S06 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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