Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis3Q6XP49 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Glis3Q6XP49 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms