Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ccdc88cQ6VGS5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ccdc88cQ6VGS5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ccdc88cQ6VGS5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ccdc88cQ6VGS5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ccdc88cQ6VGS5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc88cQ6VGS5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms