Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Timd4Q6U7R4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Timd4Q6U7R4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms