Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ0

Cd300a, CMRF35-like molecule 8, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300aQ6SJQ0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd300aQ6SJQ0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms