Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ1

Cachd1, VWFA and cache domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cachd1Q6PDJ1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cachd1Q6PDJ1 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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