Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms