Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Atl2Q6PA06 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atl2Q6PA06 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atl2Q6PA06 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atl2Q6PA06 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atl2Q6PA06 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atl2Q6PA06 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atl2Q6PA06 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atl2Q6PA06 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atl2Q6PA06 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atl2Q6PA06 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms