Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp12Q6P5B0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rrp12Q6P5B0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms