Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CltbQ6IRU5 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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