Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg9bQ6EBV9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg9bQ6EBV9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms