Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atp11bQ6DFW5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp11bQ6DFW5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms