Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sh3rf1Q69ZI1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sh3rf1Q69ZI1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sh3rf1Q69ZI1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3rf1Q69ZI1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sh3rf1Q69ZI1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sh3rf1Q69ZI1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sh3rf1Q69ZI1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sh3rf1Q69ZI1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Sh3rf1Q69ZI1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sh3rf1Q69ZI1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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