Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pkp4Q68FH0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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