Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sdc3Q64519 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Sdc3Q64519 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Sdc3Q64519 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc3Q64519 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc3Q64519 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc3Q64519 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Sdc3Q64519 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc3Q64519 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc3Q64519 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Sdc3Q64519 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Sdc3Q64519 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc3Q64519 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc3Q64519 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Sdc3Q64519 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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