Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ly6eQ64253 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms