Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Zfp248Q640N4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms