Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Sall3Q62255 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms